U okviru Sektora za unutrašnje obezbjeđenje osnivaju se tri unutrašnje organizacione jedinice i to:
- Odsjek za unutrašnje obezbjeđenje;
- Odsjek za elektroniku;
- Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine.
- Odsjek za unutrašnje obezbjeđenje vrši praćenje i pripremu propisa iz oblasti obezbjeđenja i protivpožarne zaštite; vrši poslove fizičke, tehničke i protivpožarne zaštite a koji se odnose na kontrolu ulaska, izlaska i kretanja osoba u objektima institucija Bosne i Hercegovine; izdavanje propusnica strankama i građanima za ulazak u zgradu Zajedničkih institucija Bosne i Hercegovine i Zgradu prijateljstva između Grčke i Bosne i Hercegovine; obezbjeđuje objekte i drugu opremu od uništenja, oštećenja i otuđenja; preduzima mjere za sprječavanje diverzije; vrši KDZ-e zaštitu pregledom osoba i stvari koje se unose u zgradu, vrši poslove protivpožarne zaštite.
- Odsjek za elektroniku priprema pretpostavke za unaprjeđenje tehnologije i pravila koja omogućavaju pravilno funkcionisanje informacijskog i telekomunikacijskog kao i ostalih sistema, brine se za održavanje tehničke opreme i uređaja, vrši tonsko snimanje sjednica institucija BiH, te kontrolu ispravnosti održavanja automatskih telefonskih centrala i pripadajućih uređaja.
- Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine obavlja poslove: informaciono i komunikacione tehnologije (IKT), unutrašnje kontrole i održavanja objekata i infrastrukture za potrebe pravosudnih institucija Bosne i Hercegovine (BiH). U cilju efikasnog i kvalitetnog obavljanja poslova iz nadležnosti Službe, Odsjek za podršku pravosudnim institucijama Bosne i Hercegovine je operativno i fizički izdvojen i smješten u Kompleksu zgrada pravosudnih institucija BiH na adresi Kraljice Jelene 88, u Sarajevu, (u daljem tekstu: Kompleks). U okviru Odsjeka, za potrebe pravosudnih institucija Bosne i Hercegovine, obavljaju se sljedeći poslovi:
- Poslovi IKT odnose se na održavanje, administraciju i unaprjeđenje informacionog sistema te telekomunikacijskog sistema u Kompleksu; Servisi koji se pružaju u okviru poslova IKT odnose se na globalnu informacionu te telekomunikacijsku mrežu i uključuju sljedeće: primjena IKT procedura i standarda, administracija sistema, unaprjeđenje sistema, zaštita sistema, automatizacija i kompjuterizacija procesa, razvoj programa i alata, razvoj baza podataka, administracija baza podataka, podrška korisnicima, obuka korisnika, telekomunikacije i telefonija, internet, elektronska pošta, elektronsko pohranjivanje podataka, backup i zaštita podataka, emitovanje suđenja putem interne kompjuterske mreže, pohranjivanje i arhiviranje audio-video zapisa iz sudnica, održavanje i popravak opreme i mrežne infrastrukture;
- Poslovi održavanja objekata i infrastrukture obuhvataju održavanje objekata i drugih prostora, instalacija i uređaja, rukovođenje, upravljanje i unaprjeđivanje postojećih infrastrukturnih sistema i opreme unutar Kompleksa (sistem grijanja i hlađenja, elektrosistemi, hidrosistemi, sistem video nadzora, kontrole pristupa, protivpožarne zaštite); izrada investicionih programa, predračuna, projekata i planova za investiciona i tekuća održavanja; obavljanje stručno tehničkog nadzora i učestvovanje u tehničkim pregledima i konačnim obračunima; održavanje poslovnog prostora i zelenih površina; održavanje higijene u Kompleksu i zaštita radne i životne sredine;
- Poslovi unutrašnje kontrole obuhvataju kontrolu ulaska, izlaska i kretanja osoba u Kompleksu; unutrašnju kontrola objekta 24 h; kontrolu ulaznih kapija i parking prostora; tehničko izvršavanje i nadzor nad primjenom zakonskih propisa i opštih akata iz oblasti zaštite tajnih podataka, upravljanje sistemom za video nadzor, vatro dojavu i kontrolu pristupa, zaštitu na radu; prijem i otpremu pošte za Odsjek.